Catherine Larose et Ashley Shade (Ampère) : lauréates ERC Consolidator Grants 2022

Catherine Larose, chargée de recherche CNRS et Ashley Shade, directrice de recherche CNRS, toutes deux membres du laboratoire Ampère, sont lauréates des bourses « Consolidator » attribuées par le Conseil Européen de la Recherche (ERC).

Les bourses ERC Consolidator : soutenir les scientifiques au cœur de leur carrière

Soutenant le meilleur de la recherche exploratoire dans trois grands domaines (sciences humaines et sociales, physique et ingénierie, et sciences de la vie) ces bourses récompensent des porteurs et porteuses de projets européens ayant obtenu leur doctorat 7 à 12 ans auparavant. Pouvant atteindre jusqu’à 2 millions d’euros, elles sont attribuées une fois par an pour une durée de 5 ans. Elles soutiennent des chercheurs et chercheuses à un moment crucial de leur carrière en leur permettant de s'imposer comme des leaders de leurs domaines.

Catherine Larose et le projet Paleo-MARE

Le projet Paleo-MARE vise à déterminer l'impact des métaux lourds sur la propagation de la résistance aux antibiotiques dans l'environnement, via une approche paléoécologique.

Catherine Larose

Depuis des millénaires, en libérant des métaux lourds dans l’environnement et en altérant les flux géochimiques, les humains ont perturbé l’équilibre naturel à l’échelle planétaire. Plus récemment, la production, l'utilisation et la diffusion d'antibiotiques ont entraîné la propagation de gènes de résistance aux antibiotiques (ARG). La présence de gènes de résistance aux métaux lourds (HMRGs) et de ARGs dans les génomes microbiens suggère une co-sélection, mais cela reste difficile à prouver, car les environnements récents sont exposés aux deux types de polluants. Pour résoudre cette énigme, le projet de Catherine Larose cherche à découvrir des liens entre la pollution par les métaux lourds et la propagation de la résistance antimicrobienne. Cette étude couple des analyses géochimiques et microbiologiques, depuis l'époque préindustrielle jusqu’à nos jours, en utilisant des archives paléoécologiques de sédiments et de glace. Ces résultats fourniront des données fondamentales qui pourront être utilisées pour informer les politiques sur les directives en matière d'émissions et sur le développement de médicaments.

Cette bourse me donnera la liberté de me concentrer sur des questions de recherche interdisciplinaires. Grâce à ce financement, je pourrai découvrir comment la résistance aux antibiotiques s'est propagée dans l'environnement en relation avec la pollution aux métaux lourds et retracer l'histoire évolutive des microorganismes.

Les activités de recherche de Catherine Larose portent principalement sur les écosystèmes vulnérables impactés par les activités humaines. Son travail se caractérise par son interdisciplinarité, essentielle dans le cadre d'études visant à comprendre d'importantes questions scientifiques et sociétales telles que la pollution à l'échelle mondiale et les changements climatiques.

Ashley Shade et le projet MicroRescue

Le projet MicroRescue vise à comprendre les mécanismes de sauvetage du microbiome pour promouvoir la résilience au changement climatique.

Ashley Shade

La crise climatique de la Terre menace de perturber les services écosystémiques et de déstabiliser la sécurité alimentaire. Les communautés de micro-organismes, appelées microbiomes, assurent des fonctions essentielles qui fournissent une rétroaction sur le climat et soutiennent la santé des sols et des plantes. Cependant, il est peut-être possible de récupérer les populations et les fonctions microbiennes perdues après des perturbations environnementales. Le projet MicroRescue permettra d'élaborer des stratégies qui tirent parti de la réactivation sélective de microbes dormants pour favoriser la résilience des systèmes végétaux et des sols. La dormance microbienne étant très répandue dans le sol, la réactivation permet d'accéder à une biodiversité inexploitée et pourrait fournir des solutions pour maintenir les fonctions des écosystèmes affectés par le changement climatique. Cette recherche étudiera d'abord la capacité des bactéries dormantes du sol à sauver les microbiomes dans un climat changeant et, ensuite, l'utilité de la réactivation bactérienne pour soutenir la résilience des plantes au changement climatique. Ces travaux fourniront des informations générales sur la résilience des microbiomes et identifieront des cibles microbiennes pour des interventions visant à soutenir les sols et les cultures confrontés au changement climatique.

Ce prix extraordinaire va accélérer mes recherches et me permettre de faire de nouvelles découvertes sur la façon dont nous pourrions utiliser les microbes pour aider les cultures à résister au stress dans un climat changeant.

Ashley Shade est écologiste microbienne spécialisée dans la résilience des communautés. Son travail cherche à comprendre comment la gestion des communautés microbiennes environnementales peut améliorer les systèmes alimentaires, énergétiques et environnementaux.